MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp17

Total Repeats: 676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017417	GTT	2	6	7	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017417	TTA	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017417	A	6	6	67	72	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017417	ATT	2	6	81	86	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017417	AT	3	6	91	96	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017417	GTT	2	6	112	117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017417	A	8	8	119	126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017417	ATTT	2	8	172	179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017417	CTA	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017417	TTC	2	6	213	218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017417	CTT	2	6	228	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017417	TA	3	6	273	278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017417	TAG	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017417	AATA	2	8	362	369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017417	ATTT	2	8	427	434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017417	TTTA	2	8	461	468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017417	ATCT	2	8	501	508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017417	CTA	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017417	TA	3	6	539	544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017417	TAA	2	6	568	573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017417	TAGA	2	8	584	591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017417	TAA	2	6	608	613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
23	NC_017417	AAAT	2	8	681	688	75 %	25 %	0 %	0 %	387827840
24	NC_017417	CAA	2	6	691	696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827840
25	NC_017417	ATA	2	6	737	742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
26	NC_017417	ATA	2	6	770	775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
27	NC_017417	ACA	3	9	797	805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827840
28	NC_017417	GAT	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
29	NC_017417	GAA	2	6	841	846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827840
30	NC_017417	AAAG	2	8	856	863	75 %	0 %	25 %	0 %	387827840
31	NC_017417	CAA	3	9	883	891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827840
32	NC_017417	AAT	2	6	892	897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
33	NC_017417	AAAGT	2	10	899	908	60 %	20 %	20 %	0 %	387827840
34	NC_017417	A	7	7	920	926	100 %	0 %	0 %	0 %	387827840
35	NC_017417	GAT	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
36	NC_017417	ACT	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827840
37	NC_017417	TAA	2	6	1035	1040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
38	NC_017417	AGA	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827840
39	NC_017417	GATAA	2	10	1150	1159	60 %	20 %	20 %	0 %	387827840
40	NC_017417	AAT	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
41	NC_017417	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	387827840
42	NC_017417	TAG	2	6	1275	1280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
43	NC_017417	TGC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827840
44	NC_017417	ATG	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
45	NC_017417	AGA	2	6	1380	1385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827840
46	NC_017417	ATAA	2	8	1441	1448	75 %	25 %	0 %	0 %	387827840
47	NC_017417	ATG	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
48	NC_017417	AT	4	8	1562	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	387827840
49	NC_017417	A	6	6	1570	1575	100 %	0 %	0 %	0 %	387827840
50	NC_017417	AAGTAA	2	12	1598	1609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827840
51	NC_017417	CCAG	2	8	1621	1628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017417	CTT	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017417	ACA	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017417	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017417	ATT	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017417	TAT	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017417	ATT	3	9	1780	1788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017417	TA	3	6	1807	1812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017417	TTA	2	6	1829	1834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017417	AAATAT	2	12	1841	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017417	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
62	NC_017417	TAT	2	6	1880	1885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827841
63	NC_017417	T	7	7	1909	1915	0 %	100 %	0 %	0 %	387827841
64	NC_017417	GTT	2	6	1924	1929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827841
65	NC_017417	TCTA	2	8	1937	1944	25 %	50 %	0 %	25 %	387827841
66	NC_017417	A	6	6	1944	1949	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
67	NC_017417	GCATTA	2	12	1965	1976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827841
68	NC_017417	ATC	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
69	NC_017417	ACT	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
70	NC_017417	CAG	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827841
71	NC_017417	CAT	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
72	NC_017417	A	7	7	2070	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
73	NC_017417	GAT	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827841
74	NC_017417	ATA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
75	NC_017417	AAT	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
76	NC_017417	AAT	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
77	NC_017417	GAA	2	6	2214	2219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827841
78	NC_017417	TAC	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
79	NC_017417	AGA	3	9	2312	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827841
80	NC_017417	AAG	2	6	2350	2355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827841
81	NC_017417	TAT	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827841
82	NC_017417	AGCA	2	8	2569	2576	50 %	0 %	25 %	25 %	387827841
83	NC_017417	A	6	6	2714	2719	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
84	NC_017417	TGCA	2	8	2750	2757	25 %	25 %	25 %	25 %	387827841
85	NC_017417	A	6	6	2808	2813	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
86	NC_017417	AT	3	6	2824	2829	50 %	50 %	0 %	0 %	387827841
87	NC_017417	CTT	2	6	2862	2867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017417	AT	3	6	2882	2887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017417	TA	3	6	2912	2917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017417	CCTC	2	8	2944	2951	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_017417	ACT	2	6	2966	2971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017417	GTTTG	2	10	2992	3001	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017417	AT	3	6	3040	3045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017417	T	6	6	3049	3054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017417	AGAT	2	8	3099	3106	50 %	25 %	25 %	0 %	387827842
96	NC_017417	ATT	2	6	3122	3127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827842
97	NC_017417	CT	3	6	3162	3167	0 %	50 %	0 %	50 %	387827842
98	NC_017417	ACA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827842
99	NC_017417	AGC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827842
100	NC_017417	AAT	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827842
101	NC_017417	AAACA	2	10	3306	3315	80 %	0 %	0 %	20 %	387827842
102	NC_017417	GTT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827842
103	NC_017417	ATA	2	6	3355	3360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827842
104	NC_017417	AGC	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827842
105	NC_017417	CAA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827842
106	NC_017417	TCT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827842
107	NC_017417	AGA	2	6	3449	3454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827842
108	NC_017417	ATA	2	6	3502	3507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827842
109	NC_017417	GCTT	2	8	3514	3521	0 %	50 %	25 %	25 %	387827842
110	NC_017417	AGT	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827842
111	NC_017417	CTT	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827842
112	NC_017417	ATG	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827842
113	NC_017417	TAAA	2	8	3898	3905	75 %	25 %	0 %	0 %	387827842
114	NC_017417	GCT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827842
115	NC_017417	ATA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017417	A	6	6	3960	3965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017417	TAA	3	9	4010	4018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017417	TAC	2	6	4046	4051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827843
119	NC_017417	ACA	2	6	4171	4176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827843
120	NC_017417	AAG	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
121	NC_017417	AAT	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
122	NC_017417	AAT	2	6	4236	4241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
123	NC_017417	AAG	2	6	4255	4260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
124	NC_017417	A	6	6	4272	4277	100 %	0 %	0 %	0 %	387827843
125	NC_017417	AAT	2	6	4281	4286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
126	NC_017417	CAA	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827843
127	NC_017417	TAA	3	9	4379	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
128	NC_017417	AGA	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
129	NC_017417	TAA	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
130	NC_017417	TAA	2	6	4493	4498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
131	NC_017417	AAAGT	2	10	4504	4513	60 %	20 %	20 %	0 %	387827843
132	NC_017417	T	6	6	4529	4534	0 %	100 %	0 %	0 %	387827843
133	NC_017417	AAT	2	6	4536	4541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
134	NC_017417	TAA	2	6	4553	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
135	NC_017417	TAG	2	6	4607	4612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827843
136	NC_017417	ATT	2	6	4636	4641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827843
137	NC_017417	AGA	2	6	4703	4708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
138	NC_017417	AAG	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
139	NC_017417	ATA	2	6	4729	4734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
140	NC_017417	TAT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827843
141	NC_017417	ATGA	2	8	4776	4783	50 %	25 %	25 %	0 %	387827843
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